提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
上汽集团2022年海外市场销量达101.7万辆 创新高******
中新社上海1月9日电 (浦帆)记者9日从上汽集团获悉,上汽集团2022年销售整车530.3万辆,连续十七年保持中国第一。其中,上汽海外市场销量达到101.7万辆,同比增长45.9%,创历史新高,欧洲成为上汽首个“十万辆级”海外区域市场。
上汽表示,2022年海外市场销量达到101.7万辆,连续七年成为中国车企榜首。其中,旗下自主品牌MG在澳大利亚、新西兰、墨西哥、泰国、智利等近20个国家跻身单一品牌前十名。上汽大通MAXUS海外累计销量突破22万辆,在澳大利亚、新西兰、英国等发达国家的销量占比超过80%。
去年9月,“中国汽车工业首款全球车”MG4 Electric(国内定名为MG MULAN)正式登陆欧洲市场,目前已在近三十个欧洲国家正式上市,每月新增订单超过1万个,2023年预计将进入全球超过80个国家。截至目前,MG品牌已在欧洲建设超过790家门店。
据了解,上汽目前已经建立集研发、营销、物流、零部件、制造、金融、二手车等为一体的面向全球市场的汽车产业链,在海外拥有硅谷、伦敦、特拉维夫三大研发创新中心,伦敦、慕尼黑、东京三大设计中心,泰国、印尼、印度、巴基斯坦四座生产基地及KD工厂,100余个零部件生产研发基地和1800多个营销服务网点。
此外,上汽开通了东南亚、墨西哥、南美西、欧洲等7条自营国际航线,产品和服务遍布全球90余个国家和地区,除欧洲“十万辆级”海外区域市场外,同时已形成澳新、美洲、中东、东盟、南亚五个“五万辆级”区域市场。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎)